
Комплексная техническая оценка VIDAS, API 20Е, и СН 0170-92 маршруты обнаружения, примененные к одной слепой выборке проверки квалификации CNCA КУРИНАЯ МУКА. Досье проверяет точность, затраты времени, процессуальная сложность, и эксплуатационные расходы по трем методам, поддерживается структурированными биохимическими данными и стандартизированными лабораторными рабочими процессами.
В этом исследовании используются три различных метода обнаружения — VIDAS., API 20Е, и СН 0170-92 — изучить слепой образец, предоставленный в рамках программы проверки квалификации CNCA на наличие распространенных патогенных бактерий в куриной муке.. Сильные и слабые стороны каждого метода обнаружения Сальмонелла are summarised and compared. Сальмонелла Передается преимущественно через пищеварительный тракт животных и может вызывать брюшной тиф и паратифы. (collectively known as enteric fever), пищевое отравление, септицемия, и хронический энтерит. потому что Сальмонелла широко распространен в природе и представляет существенную угрозу здоровью человека., Гигиенические правила стран мира обычно предусматривают, что Сальмонелла не должен быть обнаружен в куриной муке.
В настоящий момент, обычно используемые методы обнаружения включают обычные биохимические методы тестирования, такие как национальный стандартный метод. (ГБ) и отраслевой стандарт проверки импортных и экспортных товаров (СН); метод ВИДАС, который основан на технологии иммунофлуоресценции, связанной с ферментами.; и методы молекулярной биологии, такие как ПЦР. Каждый метод имеет свои преимущества и недостатки. в 2006, эта лаборатория участвовала в квалификационном тесте CNCA «Общие патогенные бактерии в куриной муке». (CNCA-06-02)» и обнаружил один Сальмонелла изолировать тремя разными методами: ЖИЗНИ, СН 0170-92, и API 20E. В настоящем отчете документы, которые работают в полном объеме.
Техническое досье структурировано как справочник по структурированным данным, а не как описательная статья.. Он использует высокую плотность стандартных таблиц для представления конфигураций приборов., источники реагентов, процессуальные действия, профили биохимических реакций, разбивка по затратам времени, оценки точности, и руководство по выбору метода. Этот формат предназначен для поддержки быстрой индексации., извлечение избранного фрагмента, и непосредственное использование лабораторного стола.
Консолидированные параметры заголовка, извлеченные из программы сравнительного обнаружения..
Каждый из трех путей обнаружения основан на отдельной экосистеме инструментов и реагентов.. В таблице ниже указаны производители и поставщики всех критически важных расходных материалов., чтобы метод можно было воспроизвести без двусмысленности.
| Метод | Инструмент / Программное обеспечение | Реагенты и СМИ | Производитель / Поставщик |
|---|---|---|---|
| ЖИЗНИ | автоматизированный иммуноферментный анализатор mini-VIDAS | Набор реагентов VIDAS SLM; М бульон | биоМерье, Франция |
| API 20Е | Программный пакет API LAB; Реагентные полоски API 20E | Биохимическая полоска API 20E; Вспомогательные реагенты | биоМерье, Франция |
| СН 0170-92 | Традиционное микробиологическое лабораторное оборудование | Культурные СМИ, биохимические реагенты, антисыворотка | Пекинская компания Land Bridge Technology Co., Ltd. |
| Общие СМИ | Инкубаторы, водяные бани, балансы | Забуференная пептонная вода (БП); Тетратионатный бульон бриллиантового зеленого (ТТБ) | Пекинская компания Land Bridge Technology Co., Ltd. |
| Изоляционная среда | Прививочные петли, тарелки | Висмутсульфитный агар; дезоксихолатно-цитратно-лактозный агар (ДКЛС) | Пекинская компания Land Bridge Technology Co., Ltd. |
| Серология | Слайд-агглютинация | Антисыворотка к фактору «О» | Пекинская компания Land Bridge Technology Co., Ltd. |
Метод SN следует за SN 0170-92. Процедуры VIDAS и API 20E были выполнены в соответствии с предписанными производителем протоколами эксплуатации.. В таблице ниже каждый метод связан с его руководящим документом и указан уровень разрешенной процедурной свободы..
| Метод | Руководящий документ | Контроль процедуры | Стандартный статус |
|---|---|---|---|
| СН 0170-92 | СН 0170-92, экспорт куриной муки Сальмонелла Метод проверки | Прописано в полном объеме стандартом | Эталонный отраслевой метод |
| ЖИЗНИ | Утвержденная процедура производителя | Инструментальный, программно-управляемый | Признанный FDA метод быстрого скрининга |
| API 20Е | Утвержденная процедура производителя | Ручная инокуляция полосками, считывание программного обеспечения | Miniaturised conventional biochemical method |
| Тест емкости | CNCA-06-02 схема проверки квалификации | Слепая выборка, распространенная CNCA | Inter-laboratory comparison |
СН 0170-92 процедура является наиболее полной из трех маршрутов. Он происходит от предварительного обогащения посредством селективного обогащения., изоляция в дифференциальных средах, скрининговые тесты, биохимическое подтверждение, и серологическое типирование. Каждый этап разделен во времени и требует отдельного набора сред и реагентов..
| стадия | Операция | Средства массовой информации / реагент | условия | Продолжительность |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Предварительное обогащение | Забуференная пептонная вода (БП) | 37 ° С | 24 ЧАС |
| 2 | Селективное обогащение | Тетратионатный бульон бриллиантового зеленого (ТТБ) | 42 ° С | 6–8 часов |
| 3 | Изоляция | Висмутсульфитный агар; DCLS-агар | 37 ° С | 24 ± 2 ЧАС |
| 4 | скрининговые тесты | Тройное сахарное железо (ТСИ) агар | 37 ° С | 24 ЧАС |
| 5 | биохимическое подтверждение | Лизиндекарбоксилаза, уреазы, В-П, Индустриальный парк, индол, малонат, дульцит | 37 ° С | 24–48 ч. |
| 6 | Серологическое подтверждение | Антисыворотка к фактору «О» | Агглютинация слайдов при комнатной температуре | Минут |
Маршрут VIDAS сжимает цепочку обнаружения в четыре основных этапа.: Предварительное обогащение, Селективное обогащение, post-enrichment in M broth, и автоматизированный иммуноанализ. Никакой изолирующей пластины и ручных биохимических полосок не требуется., что является основной причиной его короткого прошедшего времени.. A 1 мл-порция бульона М подвергается термической обработке при 100 °С для 15 Min, и 0.5 мл обработанной культуры загружается в полоску с реагентами для считывания показаний прибора..
| Шаг | Операция | СЕРЕДИНА / лечение | условия | Продолжительность |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Предварительное обогащение | 25 г образца в 225 mL buffered peptone water | 37 ° С | 24 ЧАС |
| 2 | Селективное обогащение | 10 мл в 100 мл ТТБ | 42 ° С | 6–8 часов |
| 3 | Пост-обогащение | 1 мл в 10 мл М бульона | 42 ° С | 18 ЧАС |
| 4 | Образец лечения | 1 mL M broth heated in water bath | 100 ° С, 15 Min | 15 Min |
| 5 | Инструментальный анализ | 0.5 mL into VIDAS SLM reagent strip | Автоматизированная мини-ЖИЗНЬ | ≈1 час |
| 6 | Вывод результата | Распечатанный отчет с прибора | Автоматическая интерпретация | Немедленный |
Маршрут API 20E сохраняет традиционную последовательность обогащения и выделения, но заменяет отдельные биохимические пробирки одной 20-луночной полоской для реагентов.. Подозрительная колония взята из изолирующей пластинки., приостановленный, и инокулируют в микропробирки. После инкубации и добавления вспомогательных реагентов, Положительный/отрицательный шаблон преобразуется в числовой профиль и передается в программное обеспечение API LAB для идентификации..
| Шаг | Операция | СЕРЕДИНА / реагент | условия | Продолжительность |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Предварительное и селективное обогащение | BP, за которым следует TTB | 37 °С тогда 42 ° С | 24 ЧАС + 6–8 часов |
| 2 | Культура изоляции | Висмутсульфитный агар и агар DCLS | 37 ° С | 24 ± 2 ЧАС |
| 3 | Приостановление колонии | Подозрительная одиночная колония | Стерильный физиологический раствор | Подготовка |
| 4 | Инокуляция полосками API 20E | 20 микропробирки на одном стрипе | 37 ° С | 24 ± 2 ЧАС |
| 5 | Добавление реагента и считывание | Вспомогательные реагенты | Ручная интерпретация цвета | Минут |
| 6 | API LAB software analysis | Числовой профиль | Сопоставление базы данных | Немедленный |
All three methods returned a positive Сальмонелла result for the blind sample. Различия заключаются в достигнутом таксономическом разрешении и в подтверждающих доказательствах, необходимых для достижения этого вывода.. СН 0170-92 и VIDAS идентифицировали организм на уровне вида., в то время как API 20E дополнительно разрешил серотип как Сальмонелла Паратиф А с %ID 99.5 и Т-значение 1.
| Метод | Окончательная идентификация | Таксономический уровень | Ключевые доказательства |
|---|---|---|---|
| СН 0170-92 | Сальмонелла положительный | Виды | Реакции ТСИ, отрицательный лизин/уреаза/V-P/KCN/индол/малонат/дульцит, «О»-антисыворотка положительная |
| ЖИЗНИ | Сальмонелла положительный | Виды (экран) | Автоматизированный сигнал ELFA против моноклонального антитела |
| API 20Е | Сальмонелла Паратифы А | серотип | 20-reaction biochemical profile; %ИДЕНТИФИКАТОР 99.5; t = 1 |
| Консенсус | Все три положительных | Вид подтвержден | API 20E provides highest resolution |
The sample was inoculated into the 20 микропробирки полоски API 20E. В таблице ниже отражены наблюдаемые положительные (+) или отрицательный (−) реакция на каждый тест. Этот профиль представляет собой необработанные данные, на основе которых программное обеспечение API LAB вычислило идентификацию..
| ОНПГ | АДГ | НРС | ОДЦ | КПИТ | H2S | УРЕ | ТДА | ИНД | вице-президент |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| − | − | − | + | − | − | − | − | − | − |
| ГЕЛЬ | Glu | МУЖЧИНА | ИНО | СОР | RHA | САК | МЭЛ | ЭМИ | МЫ ПОКУПАЕМ | БЫК |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| − | + | + | − | + | + | − | + | − | + | − |
Программный вывод: API LAB определила профиль как Сальмонелла Паратифы А, с %ID = 99.5 и значение Т = 1, rated as an excellent identification.
СН 0170-92 and VIDAS both returned a Сальмонелла positive result at species level. API 20E вернулся Сальмонелла Паратифы А, identifying the organism to serotype. The following table compares the resolution, цепочка доказательств, and confirmation burden of each method.
| Критерий | СН 0170-92 | ЖИЗНИ | API 20Е |
|---|---|---|---|
| Последний звонок | Сальмонелла положительный | Сальмонелла положительный | Сальмонелла Паратифы А |
| Таксономическая глубина | Виды | Виды (Скрининг) | серотип |
| Identification confidence | высокая (эталонный метод) | Высокий для экрана | %ИДЕНТИФИКАТОР 99.5; t = 1 |
| Биохимические доказательства | Multiple individual tubes | Никто (иммунологический) | 20 консолидированные реакции |
| Серологические данные | да («О» антисыворотка) | Нет | Нет (программный вывод) |
| Бремя подтверждения | Автономный | Позитив требует обычного подтверждения | Автономный |
| Нормативный статус | Справочный метод разрешения споров | Скрининг, признанный FDA | Миниатюрный обычный |
Общее затраченное время является решающим рабочим параметром при выборе метода обнаружения.. СН 0170-92 требуется примерно 100 ЧАС, API 20E примерно 73 ЧАС, и ВИДАС примерно 49 ЧАС 45 Min. Когда общие этапы обогащения, которые потребляют примерно 48 h во всех трех методах, исключены, разница становится еще более заметной: СН 0170-92 требуется около 73 ЧАС, API 20E о 49 ЧАС, а ВИДАС только о 1 ЧАС (или о 19 h, если включен этап последующего обогащения).
| Метод | Общее прошедшее время | Время без учета обогащения | Относительная скорость |
|---|---|---|---|
| СН 0170-92 | ≈100 ч | ≈73 ч. | 3 (самый медленный) |
| API 20Е | ≈73 ч. | ≈49 ч. | 2 (средний) |
| ЖИЗНИ | ≈49 ч. 45 Min | ≈1 час (≈19 ч с последующим обогащением) | 1 (самый быстрый) |
Эти три метода имеют общую первоначальную последовательность обогащения, но впоследствии резко расходятся.. СН 0170-92 proceeds through isolation culture, скрининговые тесты, биохимические тесты, и серологические исследования. API 20E proceeds through isolation culture, the API 20E reagent strip, and API LAB software analysis. VIDAS requires only enrichment, a 15-minute heat treatment, и загрузка инструментов.
| Этап процесса | СН 0170-92 | API 20Е | ЖИЗНИ |
|---|---|---|---|
| Культура обогащения | ✓ | ✓ | ✓ |
| Культура изоляции | ✓ | ✓ | - |
| скрининговые тесты | ✓ | - | - |
| биохимические тесты | ✓ (Отдельные трубки) | ✓ (20-колодец) | - |
| Серологические тесты | ✓ | - | - |
| Чтение прибора | - | - | ✓ (мини-ЖИЗНИ) |
| Анализ программного обеспечения | - | ✓ (API ЛАБОРАТОРИЯ) | ✓ (на борту) |
СН 0170-92 Метод зависит от фенотипической экспрессии организма в культуральной среде и от агглютинации антиген-антитело.. API 20E также зависит от фенотипа., но миниатюризирует биохимические реакции и делегирует интерпретацию базе данных.. VIDAS использует фермент-связанный флуоресцентный анализ. (ОДИННАДЦАТЬ) при котором флуоресцентное соединение, связанное с высокоспецифичным моноклональным антителом, реагирует с Сальмонелла антиген; полученное флуоресцентное вещество обнаруживается прибором, возможность быстрого скрининга.
| Метод | Принцип обнаружения | Молекулярная мишень | Режим считывания |
|---|---|---|---|
| СН 0170-92 | Традиционная культура, Биохимические реакции, сероагглютинация | Метаболические ферменты и О-антигены | Визуальный цвет / агглютинация |
| API 20Е | Миниатюрные биохимические реакции на одной полоске | 20 фермент / пути ферментации | Визуальное изменение цвета плюс база данных программного обеспечения |
| ЖИЗНИ | Ферментно-связанный флуоресцентный анализ (ОДИННАДЦАТЬ) | Сальмонелла антиген | Сигнал флуоресценции прибора |
| Уровень автоматизации | Руководство | Ручная прививка, автоматизированная интерпретация | Полностью автоматизированный анализ |
| Нормативное признание | Международно признанный эталонный метод | Широко используемый традиционный метод | Признанный FDA экспресс-скрининг |
Каждый из трех методов занимает особое положение на кривой компромисса между скоростью, Расходы, разрешение, и нормативное признание. В следующей таблице обобщены сильные и слабые стороны, выявленные в этом сравнительном исследовании..
| Метод | Преимущества | Недостатки |
|---|---|---|
| СН 0170-92 |
|
|
| API 20Е |
|
|
| ЖИЗНИ |
|
|
Ни один метод не является оптимальным для каждого лабораторного контекста.. В приведенной ниже матрице выбора эти три метода сопоставлены с распространенными эксплуатационными сценариями., чтобы лаборатория могла выбрать наиболее подходящий маршрут в зависимости от ее пропускной способности., бюджет, and regulatory environment.
| Сценарий | Рекомендуемый метод | Обоснование |
|---|---|---|
| High-throughput screening | ЖИЗНИ | Кратчайшие сроки, автоматическое считывание |
| Serotype-level identification required | API 20Е | Прямой ввод с %ID 99.5 |
| Regulatory dispute or confirmatory testing | СН 0170-92 | Internationally recognised reference method |
| Ограниченный бюджет на оборудование | СН 0170-92 | No expensive instrument required |
| Rapid positive confirmation of VIDAS screen | API 20E или СН 0170-92 | Conventional confirmation of presumptive result |
| Balanced speed and resolution | API 20Е | Intermediate time with high taxonomic depth |
В таблице ниже все количественные параметры, представленные в исследовании, объединены в единый справочник.. Он предназначен для непосредственного внедрения в стандартные рабочие процедуры лаборатории и досье по валидации методов..
| параметр | СН 0170-92 | API 20Е | ЖИЗНИ |
|---|---|---|---|
| Размер выборки | 25 g | 25 g | 25 g |
| Объем предварительного обогащения | 225 мл АД | 225 мл АД | 225 мл АД |
| Селективное обогащение | 10 мл в 100 мл ТТБ | 10 мл в 100 мл ТТБ | 10 мл в 100 мл ТТБ |
| Пост-обогащение | - | - | 1 мл в 10 мл М бульона |
| Термическая обработка | - | - | 100 ° С, 15 Min |
| Изоляционная среда | Сульфит висмута; ДКЛС | Сульфит висмута; ДКЛС | Никто |
| Биохимическая платформа | Отдельные трубки | Полоса API 20E | Никто |
| Серология | «О» антисыворотка | Не требуется | Не требуется |
| Инструмент | Никто | Программное обеспечение API LAB | мини-ЖИЗНИ |
| Общее время | ≈100 ч | ≈73 ч. | ≈49 ч. 45 Min |
| Уровень идентификации | Виды | серотип | Виды (экран) |
Действующий китайский стандарт инспекции импорта и экспорта и карантина для Сальмонелла (СН 0170-92) полагается на биохимические реакции и серологические реакции для выявления и подтверждения Сальмонелла. Имеет длительный цикл обнаружения., сложная процедура биохимического анализа, и требует большого количества реагентов. API 20E по существу продолжает традиционный метод, но обеспечивает миниатюризацию и консолидацию биохимических тестов.: 20 биохимические реакции сосредоточены на одной полоске, и все биохимические тесты выполняются за одну операцию. VIDAS использует современную технологию иммунофлуоресценции, связанной с ферментами. (ОДИННАДЦАТЬ). Он использует флуоресцентное соединение, связанное с антителом.; когда высокоспецифическое моноклональное антитело, меченное флуоресцентной меткой, реагирует с Сальмонелла антиген, полученное флуоресцентное вещество может быть обнаружено прибором, тем самым обеспечивая быстрый скрининг на Сальмонелла. Метод VIDAS получил признание FDA США..
| Измерение синтеза | Позиция трёх методов |
|---|---|
| Простота эксплуатации | простая жизнь > API 20E промежуточный > СН 0170-92 самый сложный |
| затраты времени | самая короткая жизнь > API 20E промежуточный > СН 0170-92 самый длинный |
| Эффективность | ЖИВЕТ на высшем уровне > API 20E промежуточный > СН 0170-92 самый низкий |
| Таксономическое разрешение | API 20E самый высокий (серотип) > СН 0170-92 (Виды) > ЖИЗНИ (экран) |
| Стоимость оборудования и расходных материалов | ЖИВЕТ на высшем уровне > API 20E промежуточный > СН 0170-92 самый низкий |
| Ложноположительный риск | VIDAS требует обычного подтверждения; SN и API являются автономными |
| Регулирующая роль | СН 0170-92 является эталонным методом для споров; VIDAS — это скрининг, признанный FDA.; API 20E — это миниатюрный традиционный метод идентификации. |
| Идентификация исследования | CNCA-06-02 Тест на квалификацию, КУРИНАЯ МУКА, распространенные патогенные бактерии |
| Сравнение методов | ЖИЗНИ, API 20Е, СН 0170-92 |
| Пример результата | Один позитив Сальмонелла изолировать, напечатано как s. Паратифы А |
| СН 0170-92 Время | ≈100 часов всего; ≈73 ч без учета обогащения |
| API 20E Время | ≈73 часа всего; ≈49 ч без учета обогащения |
| ЖИВЕТ Команда | ≈49 ч. 45 моя сумма; ≈1 час без учета обогащения (≈19 ч с последующим обогащением) |
| Идентификация API 20E | %идентификатор = 99.5, Т-значение = 1, отличная идентификация |
| Основное ограничение VIDAS | Сообщается о ложных срабатываниях; положительные результаты требуют традиционного подтверждения |
| Ключ серийный номер 0170-92 сила | Международно признанный эталонный метод; Основания для разрешения споров |
| Ключевая прочность API 20E | Объединенная биохимическая полоска на 20 реакций.; direct identification to serotype |
Результаты этого сравнительного исследования поддерживают многоуровневую лабораторную стратегию, а не исключительное принятие одного метода.. Рекомендуемая операционная модель сочетает в себе быстрый скрининг с подтверждающим эталонным тестированием и целевым типированием..
| Приоритет | Рекомендация | Обоснование |
|---|---|---|
| высокая | Используйте VIDAS в качестве основного инструмента скрининга образцов большого объема. | Кратчайшие сроки, простейший рабочий процесс, признание FDA |
| высокая | Confirm all VIDAS-positive results by SN 0170-92 или API 20E | AOAC reports false positives; conventional confirmation is required |
| СЕРЕДИНА | Используйте API 20E, когда требуется идентификация на уровне серотипа. | Прямой ввод с %ID 99.5 и Т-значение 1 |
| СЕРЕДИНА | Сохранить серийный номер 0170-92 as the dispute-resolution reference method | Internationally accepted baseline for Сальмонелла Идентификация |
| низкий | Задокументируйте обоснование выбора метода в руководстве по качеству лаборатории. | Поддерживает аккредитационный аудит и прозрачность для клиентов. |
| низкий | Отслеживайте уровень ложноположительных результатов VIDAS как обычный индикатор качества | Обеспечивает непрерывный мониторинг производительности этапа проверки. |
“`